El juego se ambienta en un futuro lejano, en una dimensión paralela llamada Cosmic Ark. Existe una raza de gigantescos robots, los Arks, que han permanecido dormidos durante mucho tiempo y que han despertado repentinamente para encontrar su galaxia gobernada por el malvado Chaos. Dado que estuvieron inactivos durante eones, los tres grandes Arks restantes —sabiduría, coraje y fuerza— han agotado s

El juego se ambienta en un futuro lejano, en una dimensión paralela llamada Cosmic Ark. Existe una raza de gigantescos robots, los Arks, que han permanecido dormidos durante mucho tiempo y que han despertado repentinamente para encontrar su galaxia gobernada por el malvado Chaos. Dado que estuvieron inactivos durante eones, los tres grandes Arks restantes —sabiduría, coraje y fuerza— han agotado su energía, y ahora solo queda suficiente energía para revivir a uno de ellos con el poder de vencer al malvado Chaos. Para lograr esto, se han formado tres Uniones distintas de seguidores de cada uno de los grandes Arks, compitiendo cada una por la resurrección de su respectivo Ark y, por ende, por la derrota del Chaos y el destino del mundo. Además de esta historia principal, existen varias historias de fondo de los personajes del juego. Está, por ejemplo, el trasfondo de Crimrose e Ivis, la historia de Eihwaz, o el encuentro entre Eris y Resha, entre otros.