Bajo el manto de la oscuridad, un samurái enmascarado asesina a cinco hombres a lo largo de la metrópolis de Japón: tres en Tokio, uno en Osaka y el último en Kioto. En su investigación, la policía descubre que cada hombre era miembro de los Genjibotaru, una banda de ladrones centrada en el robo de estatuas y artefactos budistas, y que se hacen llamar los sirvientes de Minomoto no Yoshitsune. Sin

Bajo el manto de la oscuridad, un samurái enmascarado asesina a cinco hombres a lo largo de la metrópolis de Japón: tres en Tokio, uno en Osaka y el último en Kioto. En su investigación, la policía descubre que cada hombre era miembro de los Genjibotaru, una banda de ladrones centrada en el robo de estatuas y artefactos budistas, y que se hacen llamar los sirvientes de Minomoto no Yoshitsune. Sin un motivo claro ni pistas sobre la identidad de los otros miembros, el caso se estanca hasta que un templo de Kioto llama al famoso Kogorou Mouri. Tras haber recibido una carta anónima con un peculiar acertijo, los monjes del templo le piden ayuda para resolverlo y recuperar su estatua perdida hace mucho tiempo. Mientras tanto, Conan Edogawa y el detective de secundaria Heiji Hattori unen fuerzas para resolver el críptico acertijo y encontrar al asesino, mientras Hattori busca al amor de su infancia. Con el conocimiento de Kioto de Hattori, los dos recorren las calles y descubren gradualmente la verdad, pero no antes de que el asesino ataque de nuevo, matando a otro miembro de los Genjibotaru y, después de repetidos intentos contra la vida de Hattori, secuestrando finalmente a la pareja de la infancia de Hattori. Solo trabajando juntos para sacar a la luz las pistas ocultas pueden Conan y Hattori esperar poner fin al derramamiento de sangre del samurái rebelde y salvar al amor de Hattori.