En el año 2066, la República de Hontworl, miembro fundador de las Naciones Unidas, abandona la organización sin explicar sus motivos. Esto provoca una indignación dentro de la ONU y pone en vilo la seguridad del mundo. Poco después de este incidente, Myori, la capital de la República de Triad, es atacada por una fortaleza volante con forma de ave conocida como el Turtle King. La Organización Cien

En el año 2066, la República de Hontworl, miembro fundador de las Naciones Unidas, abandona la organización sin explicar sus motivos. Esto provoca una indignación dentro de la ONU y pone en vilo la seguridad del mundo. Poco después de este incidente, Myori, la capital de la República de Triad, es atacada por una fortaleza volante con forma de ave conocida como el Turtle King. La Organización Científica Internacional, encabezada por el Dr. Kouzaburou Nanbu, tiene la tarea de lidiar con este misterioso enemigo. Al mismo tiempo, los principales científicos de la ISO están desapareciendo. Los cinco miembros del Science Ninja Team, los guerreros Gatchaman, son convocados para llegar al fondo del asunto. Han pasado años desde que el equipo luchó contra Berg Katze y la infame organización Galactor. ¿Podrá Ken, también conocido como el Eagle, seguir liderando a su equipo hacia la victoria contra esta fuerza suprema del mal?