La boda de Goemon con Murasaki Inabe, hija del líder de un clan samurái, se ve interrumpida cuando los ninjas Fuma atacan, secuestrando a la futura novia y exigiendo el antiguo tesoro de su familia como rescate. Lupin, Jigen, Goemon y Fujiko vuelven a trabajar juntos para intentar salvar a Murasaki y hacerse con el tesoro antes de que los Fuma puedan robarlo.