Los "Toys" son poderes otorgados a aquellos elegidos para blandirlos, cada uno con cualidades únicas para sus usuarios. Algunos de estos individuos nacen puros, usando sus poderes para convertirse en detectives. Otros florecen envueltos en veneno y eligen convertirse en ladrones fantasma. Estas dos facciones opuestas provocaron la formación de varias academias de detectives alrededor del mundo, en

Los "Toys" son poderes otorgados a aquellos elegidos para blandirlos, cada uno con cualidades únicas para sus usuarios. Algunos de estos individuos nacen puros, usando sus poderes para convertirse en detectives. Otros florecen envueltos en veneno y eligen convertirse en ladrones fantasma. Estas dos facciones opuestas provocaron la formación de varias academias de detectives alrededor del mundo, entrenando a detectives para luchar y atrapar a los ladrones fantasma. Sherlock Shellingford, Nero Yuzurizaki, Hercule Burton y Cordelia Glauca forman "Milky Holmes", un grupo reconocido como la élite de la Academia de Detectives Holmes, con sede en Yokohama. Sin embargo, en una escaramuza contra el ladrón fantasma Arsene, sus Toys desaparecen repentinamente, considerándolos no aptos para continuar como detectives. Despojados de su prestigiosa vida y arrojados a un desván destartalado, se enfrentan a la expulsión si no logran recuperar sus poderes en los próximos tres meses. Tantei Opera Milky Holmes narra la historia de un grupo que alguna vez fue legendario en su viaje para recuperar sus Toys, mientras intentan continuar su trabajo sin los poderes que una vez definieron sus carreras.